Photo Photo Photo Photo Photo Photo

Print
E-mail
Biology: Genetic Diversity Among Some Aspergillus flavus Isolates by Using Inter simple sequence repeats (ISSR)

 

Genetic Diversity Among Some Aspergillus flavus Isolates by Using Inter simple sequence repeats (ISSR)

Safa M. Abdulateef* , Mona H. Aljubori, Neamat J. Abdulbaqi

Department of Biology, College of Science, University of Baghdad , Baghdad, Iraq.

 

Abstract

     Aspergillus flavus  isolates which are considered on conidial shape through microscopic examination  and mycelial colour through cultural properties . Primary screening for the ability of A. flavus isolates for aflatoxin production was determined using A.flavus parasiticus agar medium (AFPA) as well , 7 isolates from 11 isolates give a positive result by the presence of  bright yellow-orange pigments   indicated the presence of aflatoxins. Molecular genetics techniques using DNA polymorphism have been increasingly used to characterize and identify genetic diversity and relationships among eleven A. flavus isolated from different source using the ISSR(inter simple sequence repeats)  technique. Three universal primers designed at University of British Columbia (UBC 809 , UBC 810, UBC 811) were produced (18) main bands of these bands, 53 bands were polymorphic. The size of the amplified bands ranged between 100-1,500 bp. The genetic polymorphism value of each primer was ranged between 16.98-74.4%. In terms of unique banding patterns, determine the finger print for one isolate the most characteristic banding pattern was for the isolate number 5 with primer UBS primer No.809. Genetic distances ranged from 0.12599 to 0.93644 among A.flavus isolates. Cluster analyses were performed to construct a dendrogram placed most of  the A. flavus was isolated from the different  source at the same main group.

Keywords: Aspergillus flavus, ISSR, Aflatoxin B.

التغايرات الوراثيه بين بعض عزلات Aspergillus flavus  بأستخدام تقنيه (ISSR)

صفا مجاهد عبداللطيف*, منى حمودي الجبوري، نعمت جميل عبدالباقي

قسم علوم الحياة ,كلية العلوم ,جامعة بغداد, بغداد، العراق .

الخلاصة

      عزلات فطر الرشاشيات الخضراءA.flavus) ) تم اعادة تشخيصها اعتماداً على شكل الكونيديات مجهرياً ولون الخيوط الفطريه طبقياً. تم الكشف الاولي لقابليه الفطر على انتاج سم الافلاتوكسين(Aflatoxin B1)  بواسطة الاوساط المحفزه لانتاج السم والتي تضمنت الوسط التفريقي(AFPA) ، اثبتت سبعه عزلات من ضمن احد عشر قابليتها على انتاج الافلاتوكسين وذلك بتكوينها حلقه برتقاليه اللون . استخدمت التقنيات الجزئية للكشف عن التغايرات بين العزلات عن طريق التغاير بالدنا، حيث ان تغاير الدنا قد بيًن قابليه العزلات على انتاجها للافلاتوكسين والعلاقات الوراثيه ما بين العزلات ومن اهم هذه التقنيات (ISSR)،استخدمت ثلات بادئات صممت من قبل جامعه(University of British Columbia) التي انتجت 18 حزمة اصلية من ضمنها 58 حزمة متعددة الاشكال و ذات حجم مابين 100-1,500 زوج من القواعد النيتروجينيه وقيمة التغايرات الوراثيه لكل بادئ وضعت بين مدى  ومقداره  16.9 – 74.4 % . مصطلح الحزمه المفرده تمثل البصمة الوراثيه للعزل ، حزمة مفرده واحده انتجت من العزله الخامسه للبادئ رقم (UBC809)البعد الوراثي للعزلات كان بين مدى (0.12599-0.93644)، ووضحت العلاقات بين العزل على المخططات العنقوديه (الديندروكرام) الذي ميًز العزلات اعتمادا على مصدر العزل.




alt

 

S5 Box

Login



Register

*
*
*
*
*

Fields marked with an asterisk (*) are required.